Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Samd11Q1RNF8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Samd11Q1RNF8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Samd11Q1RNF8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Samd11Q1RNF8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Samd11Q1RNF8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms