Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms