Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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