Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MestQ07646 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms