Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms