Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms