Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms