Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RykQ01887 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RykQ01887 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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RykQ01887 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RykQ01887 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RykQ01887 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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