Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms