Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms