Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Stx2Q00262 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx2Q00262 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms