Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama4P97927 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama4P97927 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms