Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms