Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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