Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms