Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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