Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lrig1P70193 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms