Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms