Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gsc2P56916 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gsc2P56916 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gsc2P56916 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gsc2P56916 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms