Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms