Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms