Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
StomP54116 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
StomP54116 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
StomP54116 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms