Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TspoP50637 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms