Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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