Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms