Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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TtlP38585 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtlP38585 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms