Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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