Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms