Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcdP28867 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcdP28867 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcdP28867 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcdP28867 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcdP28867 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcdP28867 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcdP28867 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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