Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PparaP23204 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PparaP23204 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PparaP23204 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PparaP23204 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PparaP23204 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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