Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmnb2P21619 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmnb2P21619 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmnb2P21619 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmnb2P21619 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmnb2P21619 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmnb2P21619 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmnb2P21619 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmnb2P21619 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms