Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms