Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms