Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms