Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Becn2P0DM65 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms