Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1bP0C7A0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms