Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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