Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.8 ms