Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms