Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P01811 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01811 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01811 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01811 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01811 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01811 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P01811 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P01811 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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P01811 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P01811 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01811 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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