Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01748 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01748 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms