Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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