Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms