Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
EdaO54693 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
EdaO54693 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
EdaO54693 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms