Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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