Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms