Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm3542K7N6U2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm3542K7N6U2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm3542K7N6U2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm3542K7N6U2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm3542K7N6U2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm3542K7N6U2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm3542K7N6U2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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