Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm933J3QPC1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms