Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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