Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms